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Sechs Jahre ist es nun bereits her, dass der ehemalige FBI-Agent Fox Mulder untergetaucht ist, weil er wegen angeblichen Mordes an einem Regierungsangestellten verurteilt werden sollte. Auch seine damalige Partnerin Dana Scully hat das FBI inzwischen verlassen und arbeitet nun als Ärztin in einem katholischen Krankenhaus. Doch ihre Vergangenheit holt Scully wieder ein: Das FBI steht plötzlich vor der Tür und bittet sie um Hilfe. Im US-Bundesstaat Virginia stellt das mysteriöse Verschwinden zahlreicher Frauen die Polizei vor ein Rätsel. Die Ermittler finden menschliche Überreste, aber kaum verwertbare Spuren. Schließlich wird sogar eine FBI-Agentin vermisst. Ein ehemaliger Priester mit hellseherischen Fähigkeiten behauptet, Informationen über ihren Verbleib zu haben. Er führt das FBI schließlich zu grausigen, im Eis verborgenen Leichen, und das ganze Ausmaß des Verbrechens wird klar. Werden die Ermittler seine merkwürdigen Visionen rechtzeitig entschlüsseln und das Leben der Entführten retten können? Die junge FBI- Agentin Dakota Whitney ist sich sicher, diesen Fall nur mit Hilfe von Fox Mulder und Dana Scully lösen zu können, weshalb beide wieder reaktiviert werden. Für sie ist der Neuanfang nicht einfach, denn der Fall führt sie an die Grenzen der Vorstellungskraft. Doch eines wissen die beiden sicher: Die Wahrheit ist irgendwo da draußen …