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Eine Gruppe von Ninja, angeführt von einem mysteriösen Bösewicht namens Megavolt, stiehlt elektronische Geräte aus Kraftwerken in der ganzen Stadt, und die Schildkröten werden für die Verbrechen verantwortlich gemacht. Die Schildkröten müssen einen Weg finden, Megavolt zu besiegen und ihre Namen zu löschen, bevor es zu spät ist