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Ariel, Nikos frühere Lehrmeisterin, bittet sie um Hilfe. In Xanadu, wo Niko als Waise einst aufgenommen wurde, ist das „Megamind“ völlig außer Kontrolle geraten. Als Niko und Ariel ankommen, gaukelt ihnen das „Megamind“ eine andere Realität vor. Die beiden müssen schnellstens aus diesem Irrgarten herausfinden, um das Supergehirn zu stoppen.