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Die Leiche von La Grenouille wurde gefunden. Sofort richtet sich der Verdacht auf die Direktorin des NCIS, Jenny Shepard, die den Waffenhändler erbittert verfolgt hatte und nun vom FBI suspendiert wird. Zwischenzeitlich wird auch Tony zum Verdächtigen, da er ein Verhältnis mit La Grenoilles Tochter hatte. Doch das Team tut alles, um ihre Unschuld zu beweisen und kommt dem Geheimnis schließlich auf die Spur...