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Chris ist es gelungen, Eggman von den Metarex zu befreien. Gleichzeitig hat Dark Oak Sonic gefangen genommen. Um Sonic befreien zu können, brauchen die Freunde neue Energie. Knuckles hat den rettenden Einfall, wie sie mehr Energie erzeugen können: es muss ihnen gelingen, den Master Emerald zu aktivieren. Dafür will Eggman die Energie seines Schiffes auf den Blauen Taifun übertragen. Es gelingt ihnen mit der Sonic Power Kanone ein Energiefeld zu erzeugen, durch das sie Sonic befreien können.