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Während die Turtles daran arbeiten, Fragmente des Vortex-Kristalls zur Stabilisierung ihrer Mutationen zu verwenden, plant Lord Dregg, aus den Fragmenten einen weiteren Vortex-Kristall zu erstellen, der seinen Vortex-Transporter antreibt. In der Zwischenzeit wird Dreggs Stellvertreter HiTech in den Weltraum gesprengt und durch Dreggs Spitzenwissenschaftler Mung als seinen neuen Stellvertreter ersetzt.