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Nachdem die Besatzung des gekaperten Wraith-Schiffs mit Hilfe des Retrovirus in einen menschlichen Zustand umgewandelt worden ist, überlegen alle im Team, wo man die Wraith in Menschengestalt am besten unterbringen könnte. Nach einigen Debatten einigt man sich darauf, die Wraith-Menschen auf einen einsamen Planeten zu bringen und jedem, der nachfragt, zu sagen, es handele sich um eine Viren-verseuchte Gemeinde. Zum Schutz aller anderen müssten sie dort in Quarantäne leben . Sheppard und Dr. Beckett bleiben ebenfalls auf dem Planten zurück, um die Lage dort zu beobachten. Auch der Ex-Wraith Michael befindet sich auf dem Planten. Doch als ein Wraith-Schiff sich nähert, muss das Atlantis-Team sehr schnell reagieren, um das Geheimnis von Atlantis zu bewahren …