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Casey soll seinem früheren kommandierenden Offizier Colonel James Keller helfen und bei einem Sicherheitstest im CIA-Gebäude eine wertvolle Pille entwenden. Als Chuck Caseys Hochverrat versehentlich auffliegen lässt, wird er umgehend inhaftiert. Nachdem Chuck und Sarah die dunkle Wahrheit über Colonel Keller herausgefunden haben, machen sich die beiden auf den Weg, um Casey zu helfen, aus dem Gefängnis auszubrechen, und seinen Namen wieder reinzuwaschen. Währenddessen scheint Devons Plan zu scheitern, Ellie vor Chuck und dessen Spionageleben fernzuhalten, weil diese ein Forschungsstipendium der USC erhält.