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Captain Nathan Bridger erhält auf der seaQuest einen verzweifelten Hilferuf von seinen alten Freunden Laura und Jim Huxley, die in der Miranda-Unterwasserkolonie leben. Sie bitten Bridger, ihr Leben zu retten, da in der bisher vorbildlich friedfertigen Kolonie unerklärlicherweise bürgerkriegsähnliche Zustände ausgebrochen sind. Als die seaQuest in Miranda eintrifft, stoßen Bridger und seine Besatzung nur auf Gewalttätigkeit, Zerstörungswut und Wahnsinn unter den Bewohnern. Selbst Royce Shelton, der Gründer und Leiter der Kolonie, hat keinerlei Anhaltspunkt für die erschreckende Verhaltensänderung der Einwohner von Miranda. Tony Piccolo untersucht die Umweltabschirmung der Kolonie, Dr. Smith nimmt Wasser- und Nahrungsproben, und Lucas sucht in der Datenbank der Kolonie nach möglichen Hinweisen. Doch alle Erklärungsversuche laufen ins Leere. Mittlerweile greift die Persönlichkeitsveränderung auch auf die Besatzungsmitglieder der seaQuest über. Erst als Piccolo feststellt, dass eine unbekannte Kraft Energie von der seaQuest abzieht und man kurz darauf eine geheimnisvolle blaue Unterwasserwolke entdeckt, unter der sich ein altes Forschungslabor verbirgt, kommt Captain Bridger und seine Mannschaft der Lösung des Rätsels näher…