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Während eines Kampfes gegen Madame-O und Klunk wird Rock-1 von einer Stimme in ihrem Kopf abgelenkt, die die Bionic Six um Hilfe bittet. Prof. Sharp entdeckt die Quelle des Geräusches: ein Notruf aus einer subatomaren Antimateriewelt. Rock-1, Sport-1 und IQ werden von Captain Stereopolis zu einem subatomaren Schiff transportiert. Die Welt des Captains wird durch Scarabs aktuelles Experiment zerstört. Die Bionic Six muss Scarabs Antimaterie-Experiment stoppen.