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In zwei Tagen wird die Wirkung des Modifikators des Skarabäus dauerhaft werden und jeder auf der Welt wird ihn anbeten. Prof. Sharp schickt seine neuen Bionic Six (Perceptor, Kaleidoscope und die Bandroids) nach der ursprünglichen Bionic Six, die Scarab gefangen genommen hat und in Einrichtungen auf der ganzen Welt festhält. Kaleidoskop befreit Bionic-1, Perceptor befreit Mother-1 und die Bandroids befreien die Kinder. Die Bionic Six wird nun zur Bionic Twelve, und mit der Koordination von Prof. Sharp muss das Team Scarab's Palace (früher das Weiße Haus ) angreifen und die Effekte des Modifikators umkehren.