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John und Root sind seit fast drei Tagen auf der Suche nach Shaw. Eine vage Spur führt sie in die Kleinstadt Maple im Norden des Staates New York. Dort entdecken sie, dass Samaritan vor sechs Monaten begann, die Kontrolle zu übernehmen und die Menschen wie Laborratten zu manipulieren. Bürgermeister und Polizeichef wurden ausgetauscht, unbequeme Stadträte kaltgestellt, die einstige Textilfabrik stellt jetzt Mikro-GPS-Tracker her. Sie nehmen den Kampf mit Samaritan und seinen Agenten auf, in der Hoffnung, Shaw noch lebend zu finden. Harold unterstützt sie logistisch von New York aus und muss nebenbei Detective Fusco helfen, der sich der neuen Nummer widmet. Dabei handelt es sich um den harmlos wirkenden Albert Weiss, der nur zu Besuch in New York ist. Ihn beobachtet auch Dani Silva, die nicht mehr für die Interne Ermittlung sondern für die Abteilung Organisierte Kriminalität arbeitet. Sie verlor einen wichtigen Zeugen in einem Gangprozess und sieht eine Verbindung zu Weiss. Nur widerwillig lässt sie sich schließlich von Fusco helfen, lernt am Ende aber den Wert neuer Partner schätzen.